The orphanage menceritakan tentang perjalanan hidup laura. Pada tahun 1975 di spanyol, laura yang ketika itu masih muda, diserahkan ke orang tua asuhnya untuk diadopsi. Beberapa tahun kemudian, laura yang sudah dewas kembali ke panti asuhan tempatnya tinggal dulu dengan ditemani suami tercintanya, carlos dan anak angkatnya yang berumur tujuh tahun bernama simon. Laura berencana untuk membuka kembali panti asuhan tersebut sebagai fasilitas bagi anak-anak penyandang disabilitas. Ketika berada disana, simon mengaku bahwa ia melihat seorang anak lelaki bernama tomas. Dari sana, tomas dan simon mulai berteman akrab. Simon selalu menggambar tomas dengan bentuk seorang anak lelaku yang memakai topeng.